借整肃“胡风反革命集团”之机 ，毛泽东已经考虑要如何扩大战果了，目标是肃清中共、政府、军队中的所谓的“反革命”分子（异己分子）。

大张旗鼓地控制舆论宣传并发动群众搞运动来整人一直是中共的拿手手段，毛泽东在为《关于胡风反革命集团的材料》一书写的序言中说：“我们是胜利者，各种人都向我们靠拢，未免泥沙俱下，鱼龙混杂，我们还没有来得及作一次彻底的清理。”他还说：“许多反革命分子深入到我们的“肝脏里面”来了。这决不仅是胡风分子，还有更多的其他特务分子或坏分子钻进来。”“各省市委和党组必须认识这一斗争的目的，不但在于肃清胡风反革命集团分子，主要的是借着这一斗争提高广大群众(主要是知识分子和干部)的觉悟，揭露各种暗藏的反革命分子(国民党特务分子，帝国主义的特务分子，托派分子和其他反动分子)，进一步纯洁革命队伍。”(《建国以来毛泽东文稿》第五册) ，于是，一个又一个的关于开展肃清暗藏“反革命分子”运动的指示，由中央到基层，由地方到军队，一场彻底肃清暗藏“反革命分子”的运动，在全国范围内大张旗鼓地展开。在1955年夏天两个多月内，毛泽东亲自批转的中央机关、军队系统和北京、上海、广东、河北等地的肃反报告20多件，这些报告的中心内容都是“坚决批判和克服右倾思想”。7月1日，中共中央《关于展开斗争肃清暗藏的反革命分子的指示》指出：“在很多部门，在很多地方，大量的暗藏的反革命分子是还没有被揭露和肃清的。”

8月25日，中共中央发出《关于彻底肃清暗藏的反革命分子的指示》，毛泽东将各团体中镇压的比例定为百分之五。在这种思想指导之下，洛阳拖拉机厂48名工程师和四级以上技术员中，有13人成为重点斗争对象。肃反运动后期各单位落实政策的结果证明，原来当“反革命”打的，绝大多数都不是反革命。

在1955年夏天两个多月内，就揭露出“反革命分子”和各种“坏分子”29230人，“反革命嫌疑分子”12488人，还发现了为数甚多的“小集团”。据中共高官陆定一当时向其苏联主子通报的内容，拟定全国总共审查1200万人。审查于1955年6月开始，到9月中旬时，已“仔细审查”222万人。其中已查明的反革命、叛徒和重大刑事犯罪分子有11.8万人，揭露11000个集团和派别。后来公安部长罗瑞卿报告，全国肃反运动中被审查的干部达1800余万人，查出16万“反革命”，9000余“嫌疑分子”。事实上，绝大多数都是冤案。

就这样，胡风事件在毛泽东的直接干预、掌控下，由思想、文化、文艺的论争，演变成一个肃清“反革命”的政治运动，以思想批判为起始，以逮捕入狱为结束。这其实也是毛泽东惯用的做法：当年延安整风就是从整顿思想作风，发展为到处抓特务的“抢救运动”，毛泽东不过是将他的“延安整风经验”推广到了全国。